Симбиоз широко распространен в природе и присущ многих группам растений и животных. Самым тесным вариантом симбиотического взаимодействия организмов является эндоцитобиоз, при котором симбионт живет непосредственно в клетках хозяина. Примером такого типа взаимодействия является симбиоз тли Acyrthosiphonpisumи бактерии Buchneraaphidicolastr. APS, продуцирующей для организма-хозяина ряд аминокислот и кофакторов. Читать далее…
К настоящему времени были секвенированы 14 геномов микоплазм: М.
mobile, M. penetrans, M. mycoides, M. synoviae, M. pulmonis, M. pneumoniae, M. hyopneumoniae(штаммы 232, 7448, J), M. gallisepticum, M. agalactiae, M. arthritidis, M. genitalium, M. capricolum. Из них единственным свободноживущим организмом является М. mobile. Паразитами человека являются М. pneumoniae, M. genitaliumи М. penetrans. Эти организмы поражают дыхательные пути, мочеполовой тракт, часто вызывают хронические заболевания. Существующие схемы антибактериальной терапии инфекций, вызванных представителями рода Mycoplasma, не во всех случаях эффективны, поэтому существует потребность в создании новых лекарственных средств.
Читать далее…
Бактерии используют различные регуляторные механизмы для контроля экспрессии генов. Один из важных механизмов регуляции генов связан с образованием вторичной структуры мРНК в регуляторной (или лидерной) области гена. Рибосомный белок связывается с регуляторным сайтом мРНК, имитирующим сайт связывания этого белка с рибосомальной РНК. При связывании запирается сайт инициации трансляции и рибосомальные гены не экспрессируются.
Читать далее…
Гидрофобное взаимодействие является одним из основных факторов, определяющих пространственную структуру белковой молекулы. Совокупность неполярных атомов белка, занимающих некоторую область пространства внутри молекулы, будем называть гидрофобным кластером. Как правило, среди гидрофобных кластеров белкового домена выделяется один самый большой, который называется гидрофобным ядром данного домена.
Читать далее…
Horizontal transfer or horizontal transmission (HT) can be defined as the process by which genes move between reproductively isolated species. It is not surprising that many examples of HT of transposable elements (TEs) have been identified in eukaryotes. TEs have the capacity to insert themselves into the chromosomes of possible vectors and, subsequently, into host chromosomes. They were found virtually in all investigated eukaryotes and represent the ubiquitous components of eukaryotic genomes (Bannert, Kurth, 2004; Vitte, Panaud, 2005). Recent evidence suggests that TEs may provide the genome with potent agents to generate genetic and genomic plasticity (Kidwell, Lisch, 1997). Two major classes of TEs are recognized (Wicker et al., 2007). Class I elements use RNA-mediated mechanisms for their transposition and are called retrotransposons. Two major orders of retrotransposons are recognized: LTR retrotransposons, which have long terminal repeats (LTRs); and non-LTR retrotransposons, which lack LTRs (Wicker et al., 2007). Class II elements transpose through DNA-mediated mechanisms and are called DNA transposons (Feschotte, Pritham, 2007). HT is well known for DNA transposons and LTR retrotransposons (Robertson, 1993; Silva, Kidwell, 2004). However non-LTR retrotransposons rarely undergo HT, and their phylogenies are largely congruent to those of their hosts (Malik et al., 1999).
Читать далее…
Магнитная энцефалография (МЭГ) — быстро развивающаяся область экспериментального изучения высшей нервной деятельности человека, функциональных областей мозга и диагностики различных патологий. Причиной этого является возможность неинвазивного получения данных о процессах, происходящих как в коре головного мозга, так и в глубоких его отделах.
Читать далее…
Азотфиксация – важный биохимический процесс, представляющий собой превращение молекулярного азота в ионы аммония. Несмотря на широкую распространенность азотфиксации среди различных таксономических групп, регуляция данного процесса практически не исследовалась методами биоинформатики.
Читать далее…
Одним из важных механизмов эволюции прокариот является горизонтальная передача генетического материала. Знания о горизонтально переданных генах важны для понимания структуры и эволюции генома исследуемого микроорганизма. Часто нуклеотидные последовательности геномов близких организмов неизвестны, поэтому необходимо использовать методы идентификации горизонтально переданных участков, основанные на анализе только одного генома. Известно, что каждый геном уникален по GC-составу и использованию кодонов, что позволяет произвести идентификацию, анализируя эти характеристики генома.
Читать далее…
Loading ...