Эукариотическая ДНК организована в большие петли, фиксированные основаниями на ядерном матриксе. В задачи нашей работы входило проанализировать пространственную организация 250 т.п.н. района куриной хромасомы 14, который включает кластер а-глобиновых генов, ряд генов домашнего хозяйства и генов неспицифичных эритроидной линии дифференцировки. Методом insituгибридезации с флюоресцентными ВАС-пробами к исследуемому участку нами было продемонстрировано, что в лимфоидных клетках DT40 локус организован в несколько петель, фиксированных основанием на элементах ядерного скелета. Читать далее…
Сейчас секвенирование микробных геномов становится все более широко используемым, а задачи, связанные с ним, востребованными. Одна из них – задача контроля за ошибками.
В настоящей работе содержательно решается следующая задача. Дана пара бактериальных генов. Требуется на основе анализа банковских бактериальных геномов предсказать, могут ли составляющие эту пары гены лежать на геноме на значительном расстоянии друг от друга, или же на геноме эти гены должны располагаться рядом. Также предсказание требуется дополнить характеристикой достоверности.
Читать далее…
Изогенный анализ основан на использовании почти изогенных сестринских линий, различающихся аллелями только одного гена. Это наиболее точный инструмент, позволяющий установить прямые и плейотропные эффекты конкретных генов на различные признаки. С использованием этого метода возможен поиск генов с сильным положительным эффектом на интересующие признаки. Сравнение эффектов одного и того же гена в разных генотипах позволяет определить норму реакции гена. Читать далее…
Основной функцией гемсодержащего белка цитохрома с является электронный транспорт в дыхательной цепи. Цитохром с переносит электрон от убихинон-цитохром с оксидо-редуктазы (комплекса III) на цитохром с оксидазу (комплекс IV). Помимо этого, цитохром с обладает антиоксидантной активностью, т.е. способностью окислять супероксидный анион-радикал.
Читать далее…
Протеасомы – это мультикаталитические протеазные комплексы, которые встречаются как в ядре, так и в цитоплазме клеток большинства организмов. Под словом "протеасома" обычно подразумевается 26S протеасома, состоящая из 20S коровой частицы и двух ассоциированных с ней 19S регуляторных комплексов. 20S протеасома представляет собой полый цилиндр, составленный из субъединиц двух типов: аир. Протеолитические центры протеасомы расположены на трех Р-субъединицах. Субъединицы а-типа, в свою очередь, обеспечивают регулируемый доступ субстрата и присоединение регуляторных комплексов. Важнейшей функцией протеасом на протяжении долгого времени считалось участие в убиквитин-зависимом расщеплении белков, однако в 1990х годах было впервые показано наличие у 20S протеасом эндорибонуклеазной активности. Впоследствии были идентифицированы две а-субъединицы, обладающие РНКазной активностью, а также была обнаружена способность 26S протеасом к расщеплению РНК. Кроме того, была показана, что способность 20S протеасом и их отдельных субъединиц расщеплять мРНК находится в зависимости от посттрансляционных модификаций. В исследованиях последних лет продемонстрировано участие некоторых субъединиц регуляторного 19S комплекса в регуляции транскрипции. Таким образом, есть основания рассматривать протеасому как важный элемент системы регуляции экспрессии генов на различных этапах. В силу неоценимой важности убиквитин-зависимого протеолиза для жизнедеятельности любой клетки, внимание большинства исследователей сосредоточено на изучении механизмов протеолитических активностей протеасом, и, таким образом, исследование РНКазы протеасом остается в тени.
Читать далее…
Культура клеток высших растений – это экспериментально созданная популяция соматических клеток, которая является экспериментальной биологической системой, нуждающейся в тщательном изучении. Помимо теоретического интереса к исследованию поведения растительных клеток вне организма, культура клеток имеет прямое практическое значение, что обуславливает необходимость введения в культуру ценных для медицины, ветеринарии, парфюмерии и пищевой промышленности видов высших растений. Читать далее…
В ответ на воздействия внешней среды происходит активация многих регуляторных систем, контролирующих экспрессию различных генов и оперонов. В условиях недостатка азота, фактор транскрипции TnrA в клетках Bacillussubtilisактивирует гены, ответственные за ассимиляцию альтернативных источников азота. При избытке доступного азота повышается концентрация внутриклеточного глутамина, что приводит к подавлению активности глутаминсинтетазы GS по принципу обратной репрессии. Фермент GS способен формировать белковый комплекс с TnrA, снижая его способность взаимодействовать с ДНК. В условиях азотного голодания TnrA связан с мембраной посредством белков GlnK-AmtB. Трансмембранный белок AmtB является транспортным и направляет в клетку ионы аммония. GlnK представляет собой небольшой регуляторный белок, который регулирует активность AmtB. Ранее было показано, что при переносе клеток в среду без источника азота, локализация TnrA становится цитозольной, и он быстро элиминируется из клеток. Целью данного исследования явилось установить поведение белков TnrA, GS и GlnK, участвующих в регуляции азотного метаболизма бацилл, после удаления источника азота из среды.
Читать далее…
Эндонуклеазы рестрикции (рестриктазы, ЭР) представляют собой сайт-специфические ДНК-эндонуклеазы бактерий. ЭР, относящиеся к ПА или IIS типам узнают непалиндромные последовательности ДНК и производят гидролиз обеих цепей внутри или рядом с сайтом узнавания. Такие рестриктазы являются составной частью систем рестрикции-модификации (РМ-систем), в которые помимо них входят одна или две ДНК-метилтрасферазы (метилазы), защищающие ДНК бактерии от гидролиза собственной ЭР. ЭР могут быть чувствительны не только к модификациям оснований, производимым метилазами из той же РМ системы, но и к метилированию других оснований узнаваемой последовательности. Изучение чувствительности к метилированию различных рестриктаз имеет большое значение для анализа статуса метилирования ДНК, а также для планирования генно-инженерных работ, связанных с метилированной ДНК. Данная работа посвящена изучению РМ-системы BspACI, a также исследованию зависимости степени гидролиза ДНК ЭР BspACI от присутствия С5-метилцитозинов в сайте узнавания.
Читать далее…
Loading ...