Ценные лекарственные свойства растений рода Gentianaобусловлены синтезом в них широкого спектра биологически-активных веществ. Одной из основных групп соединений, которые синтезируются в растениях этого рода, являются флавоноиды. Известно, что биосинтез флавоноидов определяется видовой принадлежностью растений, является органоспецифическим процессом, а также сильно зависит от условий произростания. Характерными флавоноидами для растений рода Gentianaявляются изоветиксин, изоориентин, лютеолин, сапонарин и изосапонарин. Объектами исследований были интактные растения горечавки (G. punctataи G. cruciata) и их каллюсные ткани. В результате проведенного анализа выявлено, что среди исследованных частей растения G.punctataсодержание флавоноидов было наивысшим в стеблях (9,055%), что в 26,9 раз превышало содержание в корнях. В каллюсе корневого происхождения содержание флавоноидов немного ниже, чем в корнях интактных растений, в то время как содержание этих веществ в каллюсе стеблевого происхождения на 61,1% превышало содержание в корнях растений. В корневом и стеблевом каллюсах содержание флавоноидов было значительно ниже (в 27,7 и 16,7 раз соответственно), чем в стеблях интактных растений. Исследование интактных растений G. cruciataпоказало, что суммарное содержание флавоноидов в листьях составляло 2,632 % от сухой массы и было наивысшим, в стеблях их количество снижалось, а в корнях было наименьшим: ниже в 18,4 раза, чем в листьях и в 15,5 раз, чем в стеблях. Исследования каллюсов корневого и стеблевого происхождения G. cruciataпоказали, что они способны синтезировать флавоноиды. К тому же, как и в случае с G. punctata, этот показатель был немного выше в каллюсе стеблевого происхождения. Нами выявлено, что суммарное содержание флавоноидов в каллюсах как стеблевого, так и корневого происхождения, превышает их содержание в корнях интактных растений в 4 и 3 раза соответственно, но ниже (в 3,8 и 5,1 раз соответственно), чем в стеблях интактных растений. Сравнительный анализ двух исследованных видов показал, что как в стеблях, так и в корнях интактных растений G. punctata, содержание флавоноидов превышало (в 3,6 и 2,4 раза соответственно) показатели у G. cruciata. Вместе с тем, обоим видам присуще то, что большее количество флавоноидов синтезируется в надземной части интактных растений и значительно меньшее – в корнях. Содержание флавоноидов в стеблевых каллюсах у обоих видов выше, чем в корневых, оно даже иногда превышает содержание в корнях интактных растений (G. cruciata).