Архив

Архив за 31st Март, 2010

Получение рекомбинантных штаммов дрожжей Pichia pastoris, экспрессирующих растворимый белок СD18

31 марта, 2010 К комментариям

Князев Д.И., Бабаев А.А.

СD 18 – β-цепь гетеродимерных адгезивных молекул, относящихся к суперсемейству интегринов и экспрессирующихся на лейкоцитах. Они участвуют в формировании адгезивных контактов, необходимых при миграции клеток иммунной системы, а также для обеспечения процесса презентации антигена. Недавно было показано наличие в сыворотке крови человека растворимых форм CD 18, которые образуются за счёт протеолитического отщепления мембранных форм (Бабаев и др., 2003; Evans et al., 2006). Нами обнаружено, что при различных патологических состояниях наблюдаются изменения концентрации в сыворотке крови растворимых форм СD 18, которые могут выступать в качестве показателей тяжести течения и прогноза заболеваний (Бабаев, 2004).

Читать далее…

Categories: Научные статьи Tags:

Управляемая молекулярная динамика разворачивания и рефолдинга белковых структур

31 марта, 2010 К комментариям

Федик И.В., Шайтан К.В.

Методами управляемой молекулярной динамики исследуются внутренние силы, приводящие к формированию уникальной структуры белка альбебетина.

Данный белок является первым искусственным белком (или белком de novo), дизайн которого основывался на теории белковых структур. Альбебетин (АВВ) был сконструирован и получен в 1991 году для выяснения принципиальной возможности создания искусственных белков с заданной структурой и свойствами. Предполагаемые структура и топология альбебетина ранее не были обнаружены в природе, однако они не противоречили известным закономерностям формирования белковой структуры. Полученный in vitro белок полностью соответствовал предсказанной структуре, а также обладал достаточной стабильностью и компактностью. Данные факты делают альбебетин привлекательным объектом для исследования механизмов формирования регулярных пространственных структур пептидной цепью и процессов сворачивания полипептидов и белков в целом.

Читать далее…

Categories: Научные статьи Tags:

Связь аминокислотного состава с термостабильностью белков

31 марта, 2010 К комментариям

Андреева Л.Ю., Ивлиев А.Е.

Гипертермофильные прокариоты – представители архей и бактерий – имеют температурный оптимум роста в интервале 80 – 110˚С, что существенно превышает значения, предельно допустимые для большинства других известных видов (мезофилов). Белки гипертермофилов проявляют устойчивость к действию высоких температур, вызывающих денатурацию белков мезофилов, и имеют в настоящее время большое технологическое значение [1, 2]. Цель работы – определить, как связан аминокислотный состав белков различных функциональных групп с их термостабильностью и как соотносятся различия в аминокислотном составе, связанные с приспособленностью организмов к определенному диапазону температур, с различиями, обусловленными их таксономической принадлежностью к бактериям или археям.

Читать далее…

Categories: Научные статьи Tags:

Изучение конформационных и динамических свойств магаинина 2 и его усеченных аналогов методом молекулярной динамики

31 марта, 2010 К комментариям

Щука Т.В., Терешкина К.Б.

Магаинины – группа коротких катионных пептидов, выделенных из кожи Африканской шпорцевой лягушки Xenopus laevis [1]. Они демонстрируют как антибактериальную, так и противораковую активность, но не проявляют гемолитических свойств. В липидных мембранах магаинины образуют а-спирали [2].

Читать далее…

Categories: Научные статьи Tags:

Молекулярная динамика сольватированных ионов в канале ГАМК-А рецептора

31 марта, 2010 К комментариям

Терёшкин Э.В.

Рецепторы гамма-аминомасляной кислоты типа А (ГАМК-А) относятся к лиганд-зависимым ионным каналам и обеспечивают синаптическую передачу путём конформационных изменений, вызываемых связыванием нейромедиатора [1]. Рецептор состоит из пяти субъединиц, образованных четырьмя ос-спиралями. Трансмембранные домены ТМ1-ТМ4 каждой из ос-спиралей формируют ионный канал. Центральная часть канала, собственно пора, образуется из ТМ2-фрагментов, обеспечивающих функциональную активность рецептора.

Читать далее…

Categories: Научные статьи Tags:

Изучение нового высокопатогенного штамма X вируса картофеля

31 марта, 2010 К комментариям

Никитин Н.А.

Впервые выделен и описан новый штамм X вируса картофеля (ХВК), названный ХВК «Ока», отличающийся исключительно высокой патогенностью.

Получен препарат вируса, свободный от примеси других штаммов ХВК. Изучены биологические свойств ХВК «Ока», а также особенности вызываемой им инфекции. Показано, что вирус вызывает образование некрозов на растениях Chenopodiumamaranticulumзначительно быстрее обычного штамма ХВК (Русский штамм, широко распространенный на территории РФ и штамм UK3). На растениях томатов, в отличие от ХВК Русского штамма и штамма UK3, этот штамм вызывает некротизацию листьев. Вирус выделен из зараженных растений и использован для выделения и характеристики вирусных РНК и белка. Физико-химические методы, трансляция РНК в бесклеточной белоксинтезирующей системе и иммуно-ферментный анализ не выявили различий между РНК, белком ХВК «Ока» и РНК, белком Русского штамма и штамма UK3 ХВК.

Читать далее…

Categories: Научные статьи Tags:

Влияние сополимера 1Ч,1Ч-диметилакриламида и N-акрилоил-ш-аминофенилборной кислоты на активность и термоагрегацию ГАФД из скелетных мышц кролика

31 марта, 2010 К комментариям

Стогов С.В.

Многие белки находятся в клетке не в свободном, а связанном состоянии. Например, в виде комплексов с нуклеиновыми кислотами, полисахаридами или другими белками. Эти взаимодействия изучены недостаточно, что связано со сложностью исследования комплексов invivo. При модельном изучении в качестве партнёров для взаимодействия с белками удобно использовать синтетические полимеры. Сотрудниками биотехнологического факультета Лундского университета был синтезирован бор-содержащий сополимер N-акрилоил-т-фенилборной кислоты и М^Ы-диметилакриламида способный образовывать ковалентные сшивки с поливиниловым спиртом и углеводными компонентами гликокаликса эндотелиоцитов. В работе было изучено влияние данного сополимера на активность и термоагрегацию глицеральдегид-3 – фосфатдегидрогеназы.

Читать далее…

Categories: Научные статьи Tags: