АНАЛИЗ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ITS И 5.8S рРНК ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ РОДА CALAMAGROSTIS
Корчагина Ю.Ю., Носов Н.Н.
Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург (Россия), Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН, Санкт-Петербург (Россия).
E-mail: ykorchagina@gmail. com
Основные объекты нашего исследования – представители рода CalamagrostisAdans. – встречаются практически во всех нетропических странах, а также в горных районах тропиков. Это многолетние травы с метельчатым, реже колосовидным многоколосковым соцветием и одноцветковыми колосками. Систематика рода Calamagrostisдо сих пор является предметом споров. Высокая плоидность большинства видов, активные гибридизационные процессы и частый апомиксис препятствуют созданию четкой системы рода и усложняют разграничение видов.
В связи с этим большое значение приобретают молекулярно-филогенетические методы, такие как сравнительный анализ последовательностей ядерных и хлоропластных генов.
В ходе работы нами был секвенирован участок ITS1-ген 5.8S рРНК-ITS2 у ранее неизученных в этом отношении видов CalamagrostisneglectaЧarundinacea, C. canescens, C. pavlovii, C. pseudophragmites. При анализе данных и построении филогенетических деревьев использовались также ITS-последовательности других представителей Poaceae,
взятых из базы данных GenBank.
Филогенетическое дерево было постороено методом объединения ближайших соседей (neighbor joining) с помощью пакета программ MEGA версия 4. Виды, принадлежащие к подтрибе Agrostidinae, располагаются на дереве в одной группе с бутстэп-индексом 99, что может говорить об их монофилетическом происхождении. Хорошо поддержанную кладу формируют представители секции PseudophragmitesC. epigeiosи С. pseudophragmites, а также C.pavlovii, предполагаемый гибрид между секциями Deyeuxiaи Calamagrostis. При этом C. pavloviiи C. pseudophragmitesобъединяются в единую группу с бутстэп-индексом 99, что противоречит традиционным представлениям об их отношениях. Можно предположить, что в образовании C. pavloviiучаствовали представители всех трех секций рода Calamagrostis.