Москалева О.В., Мельник Б.С., Столбоушкина Е.А. и др.
Институт белка РАН, Пущино (Россия).
E-mail: mosechka53@rambler.ru
Бактериальные Sm-подобные РНК-связывающие белки Hfq существуют в виде гексамеров и образуют тороидальные структуры. Белки содержат так называемый Sm-фолд, состоящий из Sm1 мотива, участвующий во взаимодействии с РНК, и Sm2 мотива, отвечающий за формирование гексамеров. Мотив Sm2 высоко консервативен в бактериальных белках, как по аминокислотной последовательности, так и по пространственной укладке цепи. Упаковка мономеров в уникальную четвертичную структуру обеспечивается объединением соседних в4 и в5 тяжей Sm2 мотива каждого мономера с образованием "сквозного" в-листа, проходящего через весь гексамер, и стабилизируется взаимодействием боковых цепей консервативных остатков, которые прикрывают межсубъединичную область от растворителя.
Нами впервые была показана высокая стабильность такой четвертичной структуры на примере белка Hfq из P. aeruginosa. Присутствие мочевины в концентрации до 8М практически не сказывается на спектре КД белка. С помощью микрокалориметрии было определено, что температурный переход белка происходит при температуре около 115-120°С (при повышенном давлении). Нами было показано, что замена консервативных аминокислотных остатков Sm2 мотива, участвующих в стабилизации четвертичной структуры, приводит к заметному уменьшению стабильности белка.
Loading ...