BioScience Blog – Научный Биологический блог

Коробейникова А.В., Пиндл В., Корепанов А.П. и др.

Институт белка РАН, Пущино (Россия),

Биоцентр, Медицинский университет, Инсбрук (Австрия).

E-mail: kav-20@rambler.ru

Белки семейства CTC, в том числе рибосомные белки TL5 Thermusthermophilusи L25 Escherichiacoli, взаимодействуют с 5S рРНК сходным образом. Контактирующие с РНК аминокислотные остатки этих белков можно разделить на две группы: консервативные и неконсервативные. Ранее нами было показано, что одновременная замена даже нескольких неконсервативных остатков в белке TL5 практически не влияет на его РНК-связывающие свойства. В того же время, одиночная замена любого из пяти консервативных остатков в белках TL5 или L25 приводила к значительной дестабилизации комплекса с 5S рРНК. Однако механизм формирования специфического комплекса 5S рРНК с белком семейства СТС оставался еще не до конца понятным.

Поэтому в настоящей работе мы исследовали кинетику взаимодействия белка TL5 и его мутантных форм с 5S рРНК методом поверхностного плазмонного резонанса. Этот метод позволил нам оценить вклад отдельных остатков белка в процессы образования комплекса и его диссоциации. Обнаружено, что скорость образования комплекса с 5S рРНК практически не изменяется для всех исследованных мутантных форм белка TL5. В то же время, все мутации в белке TL5, изменяющие его РНК-связывающие свойства (замена консервативного остатка), приводят к увеличению константы скорости диссоциации более чем на порядок. Полученные результаты свидетельствуют о том, что контактирующие с РНК консервативные остатки белка СТС важны для стабилизации уже сформированного комплекса с 5S рРНК.