BioScience Blog – Научный Биологический блог

Вданном исследовании разработан алгоритм и протестирована методика исследования коэффициента распределения физиологически активных веществ в системе октанол/вода по методу Манхольда-Реккера. В данном методе гидрофобность вещества СХНУ определяется по следующей формуле:

logP=x*f(C)+y*f(H)+n*Cm,

где f(C),f(H) – фрагментальные константы действия фрагмента в молекуле; Ст – корректирующий фактор и он равен 0,219; п – частота повторения Ст.

По данной методике были просчитаны значения logP для соединений трёх классов: замещённых хлорбензолов (12 соединений), адамантанов (38 соединений) и замещённых бромфенэтиламинов (22 соединения). Для некоторых веществ отмечен результат, не совпадающий с экспериментальным значением logP, что говорит о другом механизме гидрофобных взаимодействий в исследуемых рядах. В таблице приведены значения для некоторых соединений из исследуемых классов. Относительная ошибка для приведённых соединений составляет не более 10%.

Полученные результаты являются хорошей моделью экспериментального распределения logP и по точности превышают возможности расчётных методик, заложенных в пакет молекулярного моделирования ChemOffice. Реализованный алгоритм расчёта позволяет получить более точные уравнения КССА для прогнозирования новых высокоэффективных препаратов.

Литература

1. Mannhold Raimund, Roelof F. Rekker (2000) «The hydrophobic fragmental constant approach for calculating logP in octanol/water and alifatic hydrocarbon/water systems» // Perspectives in drug discovery and design. : Kluwer Academic Publisher.