BioScience Blog – Научный Биологический блог

Песина Д.А., Хорунжая О.В., Кашпур В.А.

Харьковский национальный университет им. В.Н. Каразина, Харьков (Украина),

Институт радиофизики и электроники им. А.Я. Усикова НАН Украины, Харьков (Украина).

E-mail: dashapesina@gmail. com

Гидратация является одним из важнейших факторов, влияющих на связывание лигандов с ДНК. Знание характеристик водно-ионного окружения комплекса ДНК-лиганд необходимо для выяснения механизмов формирования и стабилизации комплекса и для построения адекватной модели, описывающей его функционирование, что представляет интерес при рациональной разработке лекарств.

Целью настоящей работы является получение данных о степени гидратации и диэлектрических свойствах профлавина и комплекса ДНК – профлавин путем измерения комплексной диэлектрической проницаемости водных растворов этих веществ в диапазоне миллиметровых длин волн (f= 39,5 ГГц) с помощью оригинального дифференциального диэлектрометра. Диэлектрический метод основан на прямом определении разности коэффициентов затухания Дб и фазовых сдвигов Дв воды и водного раствора исследуемого образца и позволяет с высокой точностью (до одной молекулы) определить изменения количества связанной воды с макромолекулой при ее взаимодействии с лигандом.

В работе представлены результаты расчета степени гидратации профлавина и его комплекса с ДНК. Показано, что процесс комплексообразования сопровождается изменением диэлектрических свойств растворов. Обнаружено увеличение степени гидратации комплекса по сравнению с суммарным значением степени гидратации его компонентов. Рассматривается модель комплекса, учитывающая структурное состояние воды в растворе ДНК – профлавин.