BioScience Blog – Научный Биологический блог

Кипенко И.Б., Поляничко А.М.

Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург (Россия), Институт цитологии РАН, Санкт-Петербург (Россия). E-mail: kipenkoi@gmail.com

Работа посвящена исследованию взаимодействий между негистоновым белком хроматина HMGB1 и линкерным гистоном H1 в растворе, а также в комплексе с молекулой ДНК. Взаимодействуя по разным бороздкам двойной спирали, белки схожим образом изменяют структуру ДНК. Несмотря на то, что связывание каждого из белков в отдельности может носить кооперативный характер, на сегодняшний день нет чёткого представления о взаимном влиянии белков друг на друга в составе общего комплекса.

Нами был проведён анализ изменений в структуре белков и ДНК при взаимодействии, используя метод кругового дихроизма (КД). Нами были исследованы комплексы HMGB1-Н1 при разных весовых соотношениях HMGB1/H1. Было показано, что в растворе наблюдается непосредственное взаимодействие между белками Н1 и HMGB1, проявляющееся в увеличении доли б-спиральных участков в структуре белков. Кроме этого нами было показано, что в растворах трёхкомпонентных комплексов могут формироваться крупные частицы, вызывающие светорассеяние, которое проявляется в искажении формы спектра КД и в появлении сильной отрицательной полосы в области 270 нм. По этой причине, достоверный структурный анализ спектров КД становится не возможным. Условия, образования рассеивающих частиц в тройном комплексе ДНК-HMGB1-H1 зависят, как от соотношения белок/ДНК, так и от соотношения HMGB1/H1 в комплексе.