BioScience Blog – Научный Биологический блог

Охарактеризована структура генофонда хакасов по составу и частотам гаплогрупп Y-хромосомы, определяемых на основании генотипирования 52 SNP и 17 YSTR-маркеров (DYS: 385a, 385b, 388, 389I, 389II, 390, 391, 392, 393, 394(19), 426, 434, 435, 436, 437, 438, 439). Охарактеризовано 8 популяционных выборок хакасов (N=254) из Аскизского, Таштыпского и Ширинского районов Республики Хакасия.

Наиболее частыми гаплогруппами у хакасов являются Nlb(N2), Nlcl(N3a), Rial и Q. Линии RlblxM269, C3xM77, N* и ОЗ представлены единичными образцами. Лишь три гаплогрупы обнаружены во всех группах выборок (Nib, Nlcl, и Rial), при этом их частоты в разных группах значительно отличаются. Оценка межпопуляционных различий с помощью точного теста популяционной дифференциации по частотам гаплогрупп и YSTR-гаплотипов выявила достоверные отличия между парами популяционных выборок из разных районов и отсутствие различий между выборками из одного района. Наиболее частой гаплогруппой у хакасов является Nib, составляющая в выборках Ширинского района более 85%. Максимальная доля гаплогруппы Nlcl представлена в Таштыпском районе (до 30%), Rial – в Аскизском (36%). На долю гаплогруппы Q* проходится 30% всех образцов в Таштыпском районе. Проведенный анализ выявил сильную неоднородность изученных популяций по степени генетического разнообразия. Максимальное разнообразие по частотам гаплогрупп показано для выборок Таштыпского района (Н=0,75), минимальное – для Ширинского (Н=0,32). Результаты  факторного  и  кластерного  анализа гаплогрупп  и  YSTR-гаплотипов

показывают, что наиболее генетически близкими друг другу являются выборки, относящиеся к одному району, при этом наиболее удалены от всех остальных выборки Таштыпского района (несмотря на их географическую близость к Аскизскому району и удаленность от Ширинского). Оценку генетической дифференциации исследованных выборок производили с помощью анализа молекулярной дисперсии (AMOVA). При анализе частот гаплогрупп доля различий между популяциями составила 20,25%. Результаты проведенного дисперсионного анализа выявляют очень значительную долю межпопуляционных различий в общей вариабельности хакасского генофонда и свидетельствуют о значительной генетической дифференциации коренного населения Хакасии. В гаплогруппе Nib выявлено пониженное разнообразие и "звездообразная" филогения медианной сети гаплотипов, свидетельствующие о сильном локальном эффекте основателя по этой линии у хакасов. На основании матриц генетических различий по YSTR-гаплотипам в пределах основных гаплогрупп построены филогенетические древа различных популяций Южной Сибири.