Юминова А.В. Изучение структуры двухмодульного аптамера к тромбину методом кругового дихроизма
Среди аптамерных ингибиторов тромбина найден 31-звенный ДНК-аптамер с высоким протромбиновым временем. Из его первичной структуры следует, что он может иметь двух модульную структуру: формировать структуру типа G-квадруплекса, а его концы могут образовывать дуплекс. G-квадруплекс имеет характерный спектр кругового дихроизма.
Исследована температурная зависимость стабильности G-квадруплексных структур аптамеров к тромбину, а также изменение структуры 31ТВА в присутствии комплементарного олигонуклеотида.
Показано, что 31ТВА имеет структуру G-квадруплекса в присутствии ионов К+.
Введенные мутации нуклеотидов в петли не мешают сборке G-квадруплекса.
Categories: Научные статьи