Приглашаем Вас принять участие в развитии Научного блога опубликовав свои статьи.
Это можно сделать двумя способами:
1) Через специальную Форму отправки научных статей отправить статьи на проверку;
2) Зарегистрироваться на сайте и войти под своей учетной записью, далее - отправить статьи на проверку модератором.

РЕГУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ ГЕНА ГЕМОЛИЗИНА П ЦЕРЕУСНОЙ ГРУППЫ МИКРООРГАНИЗМОВ ДВУХКОМПОНЕНТНОЙ СИСТЕМОЙ СИГНАЛЬНОЙ ТРАНСДУКЦИИ RESDE

ШапыринаЕ.В., Шадрин А.М., Солонин А.С.

Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина, Пущино (Россия).

E-mail: epoxidka@rambler.ru

Bacilluscereus - широко распространенная, спорообразующая, условно-патогенная для человека грам-положительная бактерия. Некоторые штаммы B. cereus могут вызывать пищевые отравления, посттравматические инфекции, а также другие заболевания. Читать далее…

Categories: Научные статьи Tags:

Нарушения в системе альтернативного пути активации комплемента, ассоциированные со стафилококком

С.Н. ПЛЕСКОВА

АПАК (альтернативный путь активации комплемента) начинает функционировать до формирования специфических антител и служит одним из базисных механизмов опережающего иммунного ответа. Изучали микробозависимые нарушения АПАК, служащие для оценки патологических состояний организма. Антикомплементарной активностью обладали все изученные штаммы. Установлено, что нарушения в системе АПАК, по-видимому, не исчерпываются действием пептидогликана и тейхоевых кислот.

Читать далее…

Categories: Научные статьи Tags:

ЭКСПРЕССИЯ РЕКОМБИНАЦИОННЫХ БЕЛКОВ ЧЕЛОВЕКА В КЛЕТКАХ БАКТЕРИЙ

Шалгуев В.И.

Петербургский институт ядерной физики, Гатчина (Россия). E-mail: shalguev@omrb.pnpi.spb.ru

Одним из важных этапов изучения механизма гомологической рекомбинации (ГР) у эукариот является получение в препаративных количествах высокоочищенных белков — ключевых участников ГР. Хорошо известно, что белок Rad51 и его паралоги — основные участники ГР. Цель данного исследования — разработка метода получения высокоочищенных Rad51-подобных белков H. sapiensв препаративных количествах для биохимического анализа. Существует проблема экспрессии некоторых эукариотических генов в бактериях: экспрессированные рекомбинантные белки, например, отдельные белки H. sapiens, часто переходят в нерастворимое состояние, образуя тельца включения. Один из способов предотвращения образования телец включения — это добавление к аминоконцевым последовательностям рекомбинантных белков домена белка SUMO (small ubiquitin-like modifier). Домен SUMO обеспечивает шаперонный эффект и способствует увеличению растворимости полученных химерных белков. Клонирование кодирующих последовательностей человеческих белков Rad51B, Rad51C, Rad54 было проведено таким образом, что каждый ген на отдельной плазмиде оказался слитым (в одной рамке считывания) с лидерной последовательностью, кодирующей домен SUMO, и участком узнавания специфической протеазы SUMO. Для клонирования использовали плазмидные векторы pET21d (Novagen) и pASK-IBA2 (IBA), кодирующие в лидерной последовательности аффинные эпитопы двух видов: полигистидиновый (6xHis) либо стрептавидиновый (TrpSerHisProGlnPheGluLys) тракты. В результате экспрессии полученных конструкций продуцировались химерные белки Rad51B, Rad51C либо Rad54, каждый из которых содержал в лидерной последовательности: в одном случае эпитоп His6-SUMO, в другом — Strep-SUMO. Кодоновую оптимизацию обеспечили синтезом invivoдополнительных тРНК (tRNAArg3 и tRNAArg4), локализованных на отдельной плазмиде. Анализируя экспрессию плазмид в клетках BL21(DE3)ДrecA, оценили молекулярные массы рекомбинантных белков человека Rad51B (≈55 кДа), Rad51C (≈60 кДа), Rad54 (≈100 кДа). Аффинная хроматография белка Rad51C на Ni2+-NTA агарозе и последующий протеолиз белка протеазой SUMO подтвердил наличие отщепляемого N-концевого эпитопа His6-SUMO (≈15 кДа), слитого с белком Rad51C (≈45 кДа). Таким образом, была показана принципиальная возможность применения предложенных векторов для экспрессии и выделения нативных белков Rad51B, Rad51C, Rad54 в E.coli.

Categories: Научные статьи Tags:

ИССЛЕДОВАНИЕ ДНК ПОЛИМОРФИЗМА ABRAMIS BRAMA ORIENTALIS ОЗЕРА БАЛХАШ

Чиркин А.П., Ахметоллаев И.А., Айтхожина Н.А.

Институт молекулярной биологии и биохимии им. М.А. Айтхожина, Алматы (Казахстан).

E-mail: chirkin_a@mail.ru

Для определения генетического разнообразия популяций восточного леща в озере Балхаш и реки Или был проведен молекулярно-генетический анализ 16 популя-ций с использованием RAPD маркеров. Число ампликонов, генерированное 32 праймерами, в зависимости от праймера составляло от 5 до 20 и их размеры варьировали в пределах 100-2000 пн. Для количественной оценки RAPD – поли-морфизма применялась программа Quantity One-4.1.1 (BioRad). На основании полученных данных было показано, что все исследованные популяции образуют два больших кластера с коэффициентом генетического сходства 0.69. Один кластер представлен популяциями Майкамыс, Шубаркунан, Мынарал, Тасарал, Майтан и Улькен. В этом кластере генетически наиболее близкими оказались представители из популяций Улькен и Майтан, коэффициент генетического сходства которых составил 0.95 и представляющих собой устойчивую группу с большим количеством особей. Далее следуют популяции Тасарал (0.91), Мынарал (0.84), Шубаркунан (0.81) и Майкамыс (0.77). Второй большой кластер, в свою очередь делится на два подкластера (0.79). В одном подкластере три популяции из Бурлю-Тюбе, Алгазы и р.Или 115 км, где популяции Алгазы и р.Или 115 км генетически более близки (0.90) в отношении к популяции Бурлю-Тюбе (0.86). В другом подкластере объединены популяции из Аягоза, Орлиная, Чиганак, Каракум, Кукан, Коржун, Тыкшок, у которых наблюдается внутрикластерная дивергенция. Этот подкластер, состоящий из двух систем, вошли отдельно от всех расположенный представитель из популяции Аягоз, с генетической дистанцией к остальным популяциям 0.83, и образцы Орлиная и Чиганак, которые образовали одну группу с генетической дистанцией 0.94. Популяции Каракум, Кукан, Коржун, Тыкшок, где максимальное генетическое сходство наблюдается у популяций Коржун и Тыкшок 0.91, располагались отдельно от остальных популяций.

Categories: Научные статьи Tags:

Инверсионный полиморфизм популяций Chironomus balatonicus в окрестностях Казани

К.А. Петров

Обнаружены две новые популяции C. balatonicus- одного из видов-двойников C.plumosus. Проведено кариологическое исследование этих популяций. В таблице представлены данные о частоте встречаемости различных последовательностей дисков.

Читать далее…

Categories: Научные статьи Tags:

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ ЧЕТЫРЕХ МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ ДНК МАРКЕРОВ РАЗЛИЧНЫХ ПОПУЛЯЦИЙ СОКОЛОВ

Чиркин А.П., Ахметоллаев И.А., Юркевич Н.А. и др.

Институт молекулярной биологии и биохимии им. М.А. Айтхожина, Алматы (Казахстан).

E-mail: chirkin_a@mail.ru

Было проанализировано 22 представителя вида сокола-балобана Falcocherrug, обитающих на территории Казахстана. ДНК выделяли методом фенол-хлороформной депротеинизации. Для исследования были выбраны 4 микросателлитных маркера NVHfp5, NVHfp13, NVHfp46-1, NVHfp79-1, использованные ранее для выявления микросателлитных фрагментов в других популяциях. Микросателлитные фрагменты, полученные методом ПЦР реакции, анализировали на приборе ALFexpress II (Amersham). Исследованные микросателлиты показали полиморфную вариабельность во всех изученных образцах. Всего было получено 10 аллелей. Для NVHfp5, NVHfp13 выявлено по 2 варианта и для NVHfp79-1 – 3 варианта аллелей. Наибольшая гетерозиготность и информационная полиморфная изменчивость была обнаружена в NVHfp46-1 локусе, где было обнаружено 5 аллельных вариантов.

Categories: Научные статьи Tags:

Влияние гепарина на антиноцицептивные свойства дроперидола

М.Е. Пахомова

Гепарин, традиционно относимый к антикоагулянтам, как оказалось в последние годы, обладает свойствами биологического регулятора многих функций организма. В работе показано ослабляющее влияние гепарина на антиноцицептивные свойства нейролептика дроперидола при предварительной гепаринизации животного или совместном введении этих веществ.

Читать далее…

Categories: Научные статьи Tags:

НОВЫЕ СВОЙСТВА 1А2 – И WARI-ИНСУЛЯТОРОВ D. MELANOGASTER

Четверина Д.А., Ерохин М.М, Георгиев П.Г.

Институт биологии гена РАН, Москва (Россия). E-mail: dchetverina@yandex.ru

Геном высших эукариот обеспечивает сложнейшие программы развития и клеточной дифференцировки. Эти программы осуществляются за счет четкой, последовательной активации и инактивации множества генов, белковые продукты которых взаимодействуют друг с другом. Важную роль в регуляции транскрипции играют регуляторные ДНК-элементы. Это энхансеры, которые усиливают транскрипцию; сайленсеры, обеспечивающие репрессионный статус генов; и инсуляторы, для которых показана способность ограничивать активность как энхансеров, так и сайленсеров.

Читать далее…

Categories: Научные статьи Tags: