BioScience Blog – Научный Биологический блог

Киселев С.С., Комаров В.М., Масулис И.С., Озолинь О.Н.

Учреждение Российской академии наук Институт биофизики клетки РАН, Пущино (Россия).

E-mail: anthyllium@gmail.com

Одной из важнейших задач сравнительной геномики является изучение распространения повторяющихся нуклеотидных последовательностей в геномах различных групп организмов. Общеизвестно, что подобные последовательности широко распространены как среди про-, так и эукариот. Литературные данные свидетельствуют о наличии некоторой неравномерности в распространении различных мононуклеотидных повторов, вариабельности предпочтительных длин и частот их встречаемости в геномах микроорганизмов разных таксономических групп. Однако биологическая значимость этих элементов геномов остается практически не исследованной.

Читать далее…

Е.В. Карпова, Т.С. Калебина, И.С. Кулаев

Археи – это микроорганизмы, которые характеризуются некоторыми эукариотическими и прокариотическими свойствами. Структура гликопротеинов Halo-bacteriumsalinariumсходна с основным гликопротеинами эукариотических организмов [1]. Гликозилирование некоторых белков клеточной поверхности H. salinariumсходно с гликозилированием коллагена животных клеток [2]. Вышеизложенные факты навели нас на мысль о существовании в клеточной поверхности H. salinariumколлагеноподобных белков. Для проверки этого предположения нами было проведено электрофоретическое сравнение опытного и контрольного образов клеточных стенок H. salinariumпосле инкубации с клостридиопептидазой, высокоспецифичным ферментом, гидролизующим коллагеноподобные последовательности, и без неё. В результате этого опыта было показано, что при действии клостридиопепдидазы ряд белков клеточной стенки исчезает, а некоторые белки частично гидролизуются. Полученные данные свидетельствуют о том, что белки, исчезновение которых наблюдается после действия клостридиопептидазы либо сами содержат коллагеноподобные последовательности, либо закреплены в клеточной стенке с помощью белков или коротких полипептидов содержащих такие последовательности. Таким образом, результаты данной работы в совокупности с данными, представленными в литературе, позволяют предположить, что в составе клеточной поверхности H. salinariumприсутствуют коллагеноподобные гликопротеины, а значит эти микроорганизмы близки к эукариотам.

Читать далее…

Ким. Е.Р., Сорокин А.В., Евдокимова В.М., Овчинников Л.П.

Институт белка РАН, Пущино (Россия).

E-mail: katiakim22@rambler.ru

YB-1 – многофункциональный ядерно-цитоплазматический белок млекопитающих. Несколько лет назад было обнаружено, что YB-1 является субстратом одной из ключевых клеточных киназ – киназы Akt. В нашей группе было показано, что после фосфорилирования киназой Akt YB-1 снижает свою ингибиторную активность в отношении кэп-зависимой трансляции, что сказывается на наборе активно транслируемых мРНК. Ранее мы идентифицировали в молекуле YB-1 аминокислотный остаток S102 как сайт фосфорилирования киназой Akt.

Читать далее…

В.В. Карпова, Ю.А. Лопатникова, А.В. Новаковская

Неспецифическая устойчивость организма к различного рода внешним воздействиям определяется адаптивной генетической системой вида [1,2]. Оценка роли популяционно-генетических механизмов в формировании специфической реакции организма на воздействие экстремальных факторов окружающей среды имеет прямое отношение к оценке индивидуальной адаптации человека, что обуславливает теоретическое и прикладное значение проводимого исследования.

Читать далее…

Катина Н.С., Дудина М.А., Балобанов В.А. и др.

Институт белка РАН, Пущино (Россия).

E-mail: delfinium27@rambler.ru

Неправильное сворачивание белка и образование амилоидных агрегатов в органах и тканях является причиной возникновения многих серьезных заболеваний человека. Поэтому исследование процесса образования амилоидов и понимание факторов, препятствующих правильному сворачиванию белковой молекулы, являются одной из важных проблем молекулярной биологии и медицины. Для исследования влияния стабильности белка на процесс образования амилоидных структур нами были получены мутантные формы апомиоглобина, различающиеся по стабильности белковой структуры, и исследована их способность к агрегации в условиях, близких к физиологическим, рН 5,5 и температура 40°С.

Читать далее…

Касацкий П.С., Соболева Н.Г., Катунин В.И.

Петербургский институт ядерной физики РАН, Гатчина (Россия).
E.mail: pavel_kasatsky@inbox.ru

Программируемый сдвиг рамки считывания матричной РНК на один нуклеотид в 5′-направлении в процессе ее трансляции на рибосоме (-1ПСРС) – это особый механизм трансляционного контроля, который позволяет синтезировать определенное соотношение генных продуктов с двух перекрывающихся рамок считывания в отдельных генах прокариот, ретротранспозонах, мобильных элементах, во многих патогенных РНК-вирусах (коронавирусы, астровирусы, ретровирусы). Читать далее…

С.В. Казимов

Работа проводилась с июня 1997 года по начало 2000.

Цель работы: оценить влияние деятельности человека на видовой состав, численность и морфологические особенности змей в окрестностях озёр Яльчик, Глухое и Мушаньер Национального  парка «Марий Чодра», имеющих разные уровни антропогенной нагрузки. Задачи:

Читать далее…

Карпачева К.Е., Никитина Т.В., Тищенко Л.И.

Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург (Россия).

E-mail: tanik@tn3532.spb.edu

Методом количественной ОТ-ПЦР в реальном времени получены данные об экспрессии генов разных молодых субсемейств коротких диспергированных повторов SINE – AluY (Ya5, Yb8, Yb9, Y, Yc1, Yg6, Ya4, Ya8) и отдельно генов AluYb8 – в клетках хронической миелогенной лейкемии человека K562 при различных физиологических состояниях. Повторы субсемейств AluYb8 являются одними из многочисленных среди молодых семейств AluY в геноме человека (около 2 тысяч копий). Экспрессия генов оценивалась по содержанию соответствующих РНК в тотальной РНК клеток K562 при пролиферации и апоптозе, вызванном ингибитором топоизомеразы I – камптотецином (в концентрации 4 мкг/мл).

Читать далее…