Исследование фосфатного регулона грам-положительных бактерий методами сравнительной геномики
Юрьева М.В.
Неорганический фосфат – вещество, ограничивающее рост бактерии Bacillussubtilisв среде. Чтобы выжить в условиях фосфатного голодания, у B. subtilisвыработался комплекс регуляторных систем, обеспечивающий клетку свободным фосфатом для полноценного функционирования клеточного метаболизма. Экспериментально показано, что ответ на недостаок фосфора осуществляется двухкомпонентной регуляторной системой PhoP-PhoR (Hulett et al., 1995). Группа генов, экспрессия которых регулируется непосредственно данной системой, получила название Pho-регулона. Индукция или репрессия генов данного регулона позволяет транспортировать и использовать ограниченные количества фосфата более эффективно, либо использовать альтернативные его источники. Показано, что в данный регулон входят следующие гены: phoAи phoB, кодирующие щелочные фосфатазы; phoD, кодирующий фосфодиэстеразу,; оперон pstSACBABB, кодирующий фосфатный транспортер; glpQ, кодирующий белок, вовлеченный в гидролиз деацилированных фосфолипидов; опероны phoPRи resABCDE, кодирующие двухкомпонентные системы сигнальной трансдукции PhoPR и ResDE; опероны tagABи tagDEF, участвующие в синтезе полиглицеролтейхоевой кислоты; tuaABCDEFGH, отвечающего за синтез тейхуроновой кислоты; а также ген с неизвестной функцией ykoL(Antelmann et al., 2000; Pragai et al., 2002).
Создание модельных и лекарственных полимерных систем на основе поли-3-оксибутирата
Бонарцев А.П., Махина Т.К., Мышкина В.Л. и др.
Впоследнее десятилетие идет интенсивная разработка и исследование систем контролируемого высвобождения (СКВ) фармакологически активных веществ (ФАВ). Особенно активно развивается направление создания лекарственных систем долговременного направленного действия антипролиферативных и противовоспалительных ФАВ на различные патологические органы и ткани с использованием СКВ из биосовместимых и биоразлагаемых полимеров. Однако, помимо создания лекарственных систем для медицины и фармакологии СКВ могут быть использованы в фундаментальной науке для создания новых моделей долговременного локального воздействия селективных ФАВ (ингибиторов и активаторов ферментов, агонистов и антагонистов рецепторов) на различные ткани и органы. В настоящее время в качестве полимерного материала для создания СКВ широко используются синтетические биодеградируемые полимеры: полилактиды и полигликолиды. Однако, их использование сопряжено с рядом трудностей, связанных с низкой биосовместимостью этих полимеров, что объясняется развитием иммунного ответа на продукты их биодеградации.
Анатомия перикарпия плодов представителей Papaveraceae – Papaveroidae
Римская О.В.
Представители семейства Papaveraceae распространены в основном в умеренных и субтропических регионах Северного полушария. В его составе выделяют 4 подсемейства. Нами были изучены плоды представителей подсемейства Papaveroidae, относящихся к следующим родам: PapaverL.,
RoemeriaMedic, MeconopsisVig.,
ArgemoneL., CanbyaGray. В результате проведенных исследований нами были выявлен общий план строения плодов для каждого из перечисленных родов.
Молекулярная динамика зервамицина II и ряда его мутантных аналогов
Левцова О.В.
В настоящее время актуальной является проблема изучения антимикробных пептидов, действующих на широкий спектр бактерий, устойчивых к большинству известных антибиотиков. Изучение таких пептидов представляет приоритетную задачу в биофармакологии. Одним из антимикробных пептидов является зервамицин II, относящийся к классу пентаиболов, продуцируемых микопаразитическими грибами родов Emericellopsis, Trichodermaи родственных им. Он состоит из 16 остатков и содержит нестандартные аминокислотные остатки: Aib (альфа-аминоизомасляная кислота), Iva (изовалин) и Hyp (4-транс-гидроксипролин). Зервамицин II взаимодействуют с клеточной мембраной, нарушая ее ионную проницаемость. Точный механизм действия на данный момент неизвестен, однако, предположительно он обладает каналообразующей активностью.
Регуляция в системе рестрикции-модификации Ecl18kI
Бабаян Т.А., Федотова Е.А., Ершова А.С., Проценко А.С.
Система Ecl18kI принадлежит к семейству SsoII-подобных систем рестрикции-модификации (Р-М). Нуклеотидные последовательности генов, кодирующих ферменты, входящие в состав этих систем практически совпадают. Так, аминокислотная последовательность метилтрансферазы SsoII (M.SsoII) отличается от последовательности Ecl18kI (M.Ecl18kI) одним остатком: Ile56заменен на Met. Оба фермента узнают 5′-CCNGG-3′ последовательность в двутяжевой ДНК и метилируют внутренний dC с образованием 5-метил-2′-дезоксицитидина [1]. Известно, что N-концевой фрагмент M.SsoII (1-71 остатки) связывается с промоторной областью генов Р-М SsoII и обеспечивает регуляцию экспрессии генов в этой системе [2].
Сообщества пауков (Aranei) стволов деревьев Aesculus hippocastanum (Sapindales: Sapindaceae) г. Черновцы (Украина)
Федоряк М.М., Евтушенко К.В.
В современном городе, представляющем собой наиболее гетерогенные антропогенные образования с измененным составом биоты, значительная роль в улучшении качества воздушной среды принадлежит зеленым насаждениям и, прежде всего, деревьям. В то же время, деревья крупных городов сами страдают от переуплотнения и засоленности почв, загрязнения атмосферного воздуха пылью и выхлопными газами автомобилей и др. Как следствие, такие деревья более подвержены болезням и паразитам, ослаблены. Ситуация может усугубляться массовым развитием вредителей. Яркий пример тому – стремительное распространение с 1985 г. на евроазиатском континенте каштановой минирующей моли CamerariaohridellaDeschka & DimiL, 1986 (Lepidoptera, Gracillariidae), вызвавшее многочисленные очаги поражения каштанов в городах Европы, в том числе и Украины (Акимов и др., 2003 а, 2006).
Биосинтез эндонуклеазы рекомбинантным штаммом Serratia marcescens
Шах М.Р., Филимонова М.Н.
Внеклеточная эндонуклеаза (КФ 3.1.4.9) Грам отрицательных бактерий Serratiamarcescensявляется одним из наиболее изученных ферментов в ряду бактериальных нуклеаз с широкой специфичностью. Нуклеаза S. marcescens(Sma nuc) расщепляет одно и двухцепочные ДНК и РНК с образованием фрагментов разной степени полимерности, фосфорилированных в 5´-положении. Благодаря биологической активности эндонуклеазу применяют на практике (Аликин и др, 1998). Несмотря на значительный прогресс в исследовании Sma nuc: установлены ключевые биохимические свойства, структура, механизм действия, – изучение нуклеазы продолжается. В частности, задачей настоящего исследования было проведение анализа динамики роста и биосинтеза нуклеазы рекомбинантным штаммом S.marcescensprt4, несущим плазмиду со структурным геном nuc. Для решения поставленной задачи провели отбор наиболее активного по нуклеазе клона бактерий на селективной питательной среде, включающей ДНК или РНК и индикатор метиловый зеленый. Затем отобранный клон выращивали на среде LB, содержащей 0,05% ампициллина, при 37°С. Установлено, что биосинтез эндонуклеазы представляет двухступенчатый процесс, проявлением которого служат два пика активности на кривой накопления нуклеазы в питательной среде. Вершина первого пика с 18-ым часом роста и развития микробной популяции, второго – с 23-им часом, что соответствовало стационарной фазе. При этом уровень активности фермента на 23-ий час культивирования бактерий был выше, чем на 18-ый час. В обоих случаях эндонуклеаза была представлена двумя изоформами, что установлено электрофорезом в полиакриламидном геле в сочетании с субстратным блоттингом.
СВЯЗЬ ВАРИАНТОВ СТРУКТУРНОГО ГЕТЕРОХРОМАТИНА С УРОВНЕМ СПОНТАННЫХ ХРОМОСОМНЫХ АБЕРРАЦИЙ НА ПРИМЕРЕ АНАЛИЗА ШОРСКОЙ И РУССКОЙ ПОПУЛЯЦИЙ
Макеева Е.А.
В современном мире малые этнические группы, стремясь сохранить свою уникальность, проживают в относительной изоляции. Такие «изоляты» способны накапливать собственный «генетический груз», т.е. ряд генов, ответственных за формирование наследственных патологий.